シングルセルRNA-seqのデータ可視化方法を比較してみた!
scRNA-seqのデータは多変量データなので、我々の認識できる形に可視化するためには次元削減が必要です。今回はその可視化方法としてt-S
scRNA-seqのデータは多変量データなので、我々の認識できる形に可視化するためには次元削減が必要です。今回はその可視化方法としてt-S
FFPE検体では、RNAのクオリティが下がることが知られています。今回、薄切されたヒト腫瘍組織のFFPEサンプルからRNAを抽出しました。
シングルセル(核)RNA-seq解析では、裸核操作を行いますが、神経組織にはミエリンのようなデブリスが多く核カウントに悪影響を及ぼします。